山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室主要围绕新发和再发传染病的感染免疫机制、分子流行病学及预防控制开展科学研究工作。实验室现有四个研究方向：新发病毒性传染病、病媒生物与虫媒病、分子流行病学和病原感染与肿瘤。实验室现有教授7名，副教授17名，讲师12名，其中二级教授2名，山东省有突出贡献中青年专家2名，泰山学者特聘教授1名，泰山学者青年专家1名，山东省高等学校重点学科首席专家1名。近五年来，实验室承担省级以上课题38项，其中“十三五”国家科技重大专项“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”子课题1项，国家自然科学基金19项，山东省科技发展计划3项，山东省自然科学基金16项；发表SCI收录论文53篇，其中埃博拉病毒研究成果发表于《Nature》，新型H7N9禽流感溯源研究成果先后有两篇发表于《Lancet》，2017年先后有两篇柯萨奇A组病毒研究成果发表于病毒学主流期刊《Journal of Virology》；获山东省科技进步奖二等奖2项，西藏自治区科学技术二等奖1项，申报国家发明专利8项。实验室拥有生物安全二级实验室、生物信息学分析平台、媒介生物学、病因流行病学、恶性肿瘤研究等多个模块化功能实验室，面积1800余M2。实验室采取“请进来、走出去”的方针，聘请外单位专家来学科进行交流；召开泰山医学院新发传染病溯源及防控协同创新中心建设推进会；选派德才兼备的优秀教师到国内外著名大学、科研机构等学习、进修。实验室按照“联合、开放、流动、竞争”的机制运行，建立和完善人才竞争、流动机制和激励性分配机制，实行灵活的用人制度和开放的实验室管理制度，逐渐形成了机构开放、人员流动、内外联合、竞争创新、产学研一体化的高效运行机制。
新发传染病病因流行病学实验室取得了一系列标志性成果，并对国家和地方经济及社会发展做出积极贡献。实验室埃博拉病毒、新型禽流感H7N9等溯源及基因组动态重配研究，成果发表于《Nature》、《Lancet》等国际顶级杂志，并为高致病禽流感的整体生态防控提供了思路；蝇类综合生物防治已得到推广应用，获山东省科技进步二等奖等科技奖励及专利授权，取得了良好的经济和社会效益；真菌毒素DON导致关节软骨病发病机制、地方性肱骨短小畸形病因流行病学研究达到国内领先水平，成果曾获山东省科技进步奖二等奖；大型研究调查“西藏大骨节病病情、发病机制及换粮控制大骨节病流行的人群干预” 的研究成果对于我国大骨节病防治具有重要的指导意义，获得2016年度西藏自治区科学技术二等奖。2016年实验室被评为山东省科普教育基地。
